Advances in the phylogeny of the genus Tulostoma in Mexico, new records for the country, Jalisco and Zacatecas

Avances en la filogenia del género Tulostoma en México, nuevos registros para el país, Jalisco y Zacatecas

Authors

  • Olivia Rodríguez Alcántar Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Departamento de Botánica y Zoología.
  • Darío Figueroa-García Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Departamento de Botánica y Zoología.
  • Eduardo Ruíz-Sanchez Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Departamento de Botánica y Zoología. Laboratorio Nacional de Identificación y Caracterización Vegetal (LaniVeg).
  • Pilar Zamora-Tavares Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Departamento de Botánica y Zoología. Laboratorio Nacional de Identificación y Caracterización Vegetal (LaniVeg).
  • María de Jesús Herrera-Fonseca Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Departamento de Botánica y Zoología.
  • Martín Esqueda Centro de Investigación en Alimentación y Desarrollo A.C.
  • Ofelia Vargas-Ponce Universidad de Guadalajara. Centro Universitario de Ciencias Biológicas y Agropecuarias. Departamento de Botánica y Zoología. Laboratorio Nacional de Identificación y Caracterización Vegetal (LaniVeg).

DOI:

https://doi.org/10.32870/e-cucba.vi24.375

Keywords:

Agaricaceae, Agaricales, Filogenia molecular, ITS, Neotropical, nucLSU

Abstract

Los hongos del género Tulostoma forman parte del orden Agaricales. Estos hongos comprenden un grupo monofilético caracterizado por basidiomas globosos-estipitados, una gleba pulverulenta y un estípite con una volva o estructura volvoide. Tulostoma se considera cosmopolita; sin embargo, se sabe poco sobre su diversidad de especies y relaciones filogenéticas en la región neotropical. Utilizamos especímenes de Tulostoma de México para evaluar la diversidad global del género Tulostoma y las relaciones filogenéticas de las especies neotropicales. Se utilizaron secuencias de ADN de dos regiones, la región espaciadora transcrita interna (ITS) y la subunidad nuclear 28S (LSU), para construir una hipótesis filogenética y discutir las relaciones filogenéticas con especies de Tulostoma paleotropicales y paleárticas. Se analizaron un total de 224 secuencias de Tulostoma, incluidas 16 secuencias nuevas de especímenes mexicanos y una de España. Los resultados filogenéticos, que consideraron tanto caracteres morfológicos como las secuencias ITS y LSU, no respaldaron la identificación previa de la mayoría de los 16 especímenes mexicanos de Tulostoma, que se basó en caracteres morfológicos. El análisis filogenético validó un nuevo reporte de Tulostoma para México, T. rufum, y tres nuevos registros de Tulostoma para el occidente de México (Tulostoma fimbriatum, T. striatum y T. xerophilum) paleotropicales y paleárticas presentes en la región neotropical, lo que evidencia la alta diversidad del género en esta región que ha sido poco estudiada. Nuestro estudio contribuye al conocimiento del género Tulostoma, que incluye especies consideradas pseudocrípticas debido a su alta variabilidad morfológica. Además, nuestro estudio enfatiza la necesidad de técnicas moleculares para apoyar la determinación de taxones.

References

Altés, A. & Moreno, G. (1995). Tulostoma fimbriatum, the correct name for Tulostomareaderi. Mycotaxon, 56, 421-425.

Altés, A. & Moreno, G. (1999). Notes on type materials of Tulostoma (Tulostomataceae) T. macrosporum, T. meridionale, T. utahense. Persoonia, 17(2), 259-264.

Calonge, F.D. (1998). Gasteromycetes, I. Lycoperdales, Nidulariales, Phallales, Sclerodermatales, Tulostomatales. Flora Mycologica Iberica, Madrid, España. 271 pp.

Darriba, D., Posada, D., Kozlov, A.M., Stamatakis, A., Morel, B. & Flouri, T. (2020). ModelTest-NG: A New and Scalable Tool for the Selection of DNA and Protein Evolutionary Models. Molecular Biology and Evolution, 37(1), 291-294. https://doi.org/10.1093/molbev/msz189

Doyle, J.J. & Doyle, J.L. (1987). A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, 19(1), 11-15.

Edler, D., Klein, J., Antonelli, A. & Silvestro, D. (2021). RaxmlGUI 2.0: A graphical interface and toolkit for phylogenetic analyses using RAxML. Methods in Ecology and Evolution, 12, 373-377. https://doi.org/10.1111/2041-210X.13512

Esqueda, M., Gutiérrez, A., Coronado, M.L., Lizárraga, M., Raymundo, T. & Valenzuela, R. (2012). Distribución de algunos hongos gasteroides (Agaricomycetes) en la planicie central del Desierto Sonorense. Scientia Fungorum, 3(36), 1-8. https://doi.org/10.33885/sf.2012.3.1099

Esqueda, M., Pérez-Silva, E., Villegas, R.E. & Araujo, V. (1995). Macromicetos de zonas urbanas, II: Hermosillo, Sonora, México. Revista Mexicana de Micología, 11, 123-132. https://doi.org/10.33885/sf.1995.3.833

Esqueda, M., Moreno, G., Pérez-Silva, E., Sánchez, A. & Altés, A. (2004). The genus Tulostoma in Sonora, Mexico. Mycotaxon, 90(2), 409-422.

GenBank. (2024). Nucleic Acids Research. https://academic.oup.com/nar.

Hernández-Caffot, M.L., Domínguez, L.S., Hosaka, K. & Crespo, E.M. (2011). Tulostoma domingueziae sp. nov. from Polylepis australis woodlands in Córdoba Mountains, central Argentina. Mycologia, 103(5), 1047-1054. https://doi.org/10.3852/10-266

Hernández-Navarro, E., Gutiérrez, A., Ramírez-Prado, J.H., Sánchez-Teyer, F. & Esqueda, M. (2018). Tulostoma rufescens sp. nov. from Sonora, Mexico. Mycotaxon, 133(3), 459-471. https://doi.org/10.5248/133.459

Hernández-Navarro, E., López-Peña, D., Gutíerrez, A., Coronado, M.L., Álvarez-Bajo, O., Andrade, S., Barredo-Pool, F. & Esqueda, M. (2020). Diversity, morphological variability, and distribution of tulostomataceos fungi (Agaricomycetes) in Sonora, Mexico. Revista Mexicana de Biodiversidad, 91, e91246.https://doi.org/10.22201/ib.20078706e.2020.91.3246

Hopple, J.S. & Vilgalys, R. (1999). Phylogenetic relationships in the mushroom genus Coprinus and dark spored allies base on sequence data from the nuclear gene coding for the large ribosomal subunit RNA: divergent domains, outgroups, and monophyly. Molecular Phylogenetics and Evolution, 1381, 1-19 https://doi.org/10.1006/mpev.1999.0634

Hussain, S., Yousaf, N., Afshan, N., Niazi, A., Ahmad, H. & Khalid, N. (2016). Tulostoma ahmadii sp. nov. and T. squamosum from Pakistan. Turkish Journal of Botany, 40(2), 218-225. http://dx.doi:10.3906/bot-1501-9

Index Fungorum. (2024). The global fungal nomenclature. http://www.indexfungorum.org/names/Names.asp.

Jeppson, M., Altés, A., Moreno, G., Nilsson, R.H., . Loarce, Y., de Bustos, A. & Larsson, E. (2017). Unexpected high species diversity among European stalked puffballs – a contribution to the phylogeny and taxonomy of the genus Tulostoma (Agaricales). MycoKeys, 21, 33-88. https://doi.org/10.3897/mycokeys.21.12176

Jiang, W., Chen, S.Y., Wang, H., Li, D.Z. & Wiens, J.J. (2014). Should genes with missing data be excluded from phylogenetic analyses?. Molecular Phylogenetics and Evolution, 80, 308-318. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2014.08.006

Kumar-Dutta, A., S. Paloi & Acharya, K. (2020). New record of Tulostoma squamosum (Agaricales: Basidiomycota) from India based on morphological features and phylogenetic analysis. Journal of Threatened Taxa, 12(3), 15375-15381. https://doi.org/10.11609/jott.5663.12.3.15375-15381

Miller, M., W. Pfeiffer & Schwartz, T. (2010). Creating the CIPRES Science Gateway for inference of large phylogenetic trees. Gateway Computing Environments Workshop 14, 1-8. http://dx.doi.org/10.1109/GCE.2010.5676129

Moreno, G., Altés, A. & Wright, J.E. (1992). Tulostoma squamosum, T. verrucosum and T. mussooriense are the same species. Mycotaxon, 43, 61-68.

Moreno, G., Altés, A., Ochoa, C. & Wright, J.E. (1995). Contribution to the study of the Tulostomataceae in Baja California, Mexico. 1. Mycologia, 87(1), 96-120. http://dx.doi.org/10.2307/3760953

Moreno, G., Altés, A., Ochoa, C. & Wright, J.E. (1997). Notes on type materials of Tulostoma. Some species with mixed holotypes. Mycological Research, 101(8), 957-965. https://doi.org/10.1017/S0953756297003572

Moreno, G., Kreisel, H. & Altés, A. (2001). Notes on the genus Tulostoma in H. Kreisel Herbarius. Cryptogamie, 22(1), 57-66.

Morrone, J.J. (2019). Regionalización biogeográfica y evolución biótica de México: encrucijada de la biodiversidad del Nuevo Mundo. Revista Mexicana de Biodiversidad, 90. e902980.

Rehman-Niazi, A., Ghafoor, A., Afshan, N. & Moreno, G. (2022). Tulostoma loonbanglaense: A new species from Azad Jammu and Kashmir using light and scanning electron microscopy and DNA barcoding technique. Microscopy Research & Technique, 85(12), 3720-3725. https://doi.org/10.1002/jemt.24240

Rusevska, K., Calonge, F.D., Karadelev, M. & Martín, M.P. (2019). Fungal DNA barcode (ITS nrDNA) reveals more diversitythan expected in Tulostoma from Macedonia. Turkish Journal of Botany, 43(1), 102-115. https://doi.org/10.3906/bot-1804-38

Stamatakis, A. (2014). RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies. Bioinformatics, 30(9), 1312-1313. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btu033

White, T., Bruns, T., Lee, S. & Taylor, J. (1990). Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis, M., D. Gelfand, J. Sninsky & T. White (Eds.). PCR Protocols: A guide to methods and applications. Academic Press, New York, USA. 482 pp.

Wiens, J.J. & Morrill, M.C. (2011). Missing data in phylogenetic analysis: reconciling results from simulations and empirical data. Systematic Biology, 60(5), 719-731. https://doi.org/10.1093/sysbio/syr025

Wright, J.E., Herrera, T. & Guzmán, G. (1972). Estudios sobre el género Tulostoma en México (Fungi, Gasteromycetes). Ciencia, 27, 109-122.

Wright, J.E. (1987). The genus Tulostoma (Gasteromycetes) – a world monograph. J. Cramer, Berlin-Stuttgart, Germany. 338 pp.

Published

2025-01-01

How to Cite

Rodríguez Alcántar, O., Figueroa-García, D., Ruíz-Sanchez, E., Zamora-Tavares, P., Herrera-Fonseca, M. de J., Esqueda, M., & Vargas-Ponce, O. (2025). Advances in the phylogeny of the genus Tulostoma in Mexico, new records for the country, Jalisco and Zacatecas: Avances en la filogenia del género Tulostoma en México, nuevos registros para el país, Jalisco y Zacatecas. E-CUCBA, (24), 34–51. https://doi.org/10.32870/e-cucba.vi24.375

Most read articles by the same author(s)